Subkortikala strukturer

Hjärnbarkens förmåga att behandla sensorisk information, associera denna med med emotionella tillstånd, lagra den som minne och initiera handling moduleras av tre strukturer djupt inne i cerebrala hemisfärerna:

• Basala ganglia - dessa reglerar rörelse och färdighetsinlärning. De tar emot input från alla delar av hjärnbarken, men skickar den vidare endast till frontalloben via thalamus.
• Hippocampus och med detta associerade kortikala regioner har stor betydelse för formeringen av långtidsminnen.
• Amygdala är beläget precis rostralt om hippocampus och analyserar den emotionella eller motiverande betydelsen av sensoriska intryck då den tar emot information direkt från de viktigaste sensoriska systemen. Output går till neocortex, basala ganglia, hippocampus och många andra subkortikala strukturer, som exempelvis hippocampus. Amygdala bestämmer således det kroppsliga svaret på en viss känslomässig situation.